Trong phần 1 của bộ phim Black Lagoon, một doanh nhân người Nhật đã bị cướp biển bắt cóc và nhiều người tưởng rằng anh ta đã tử nạn. Tuy nhiên, thay vì chết, anh ta đã trở thành thành viên của nhóm cướp biển đó. Doanh nhân này tên là Toyoguchi Megumi và anh gia nhập nhóm với sự giúp đỡ của Namikawa Daisuke và Isobe Tsutomu. Cuộc sống mới của Toyoguchi Megumi trong nhóm cướp biển này đầy gian nan và mạo hiểm, khiến cho câu chuyện trở nên hấp dẫn và ly kỳ.
